審計局設下列內設機構：
（一）辦公室。協助局領導，組織、管理、協調機關日常工作；負責機關文電、調研、宣傳信息、會務、機要、保密、檔案、政務公開、電子政務、督查督辦、政務協調和信訪工作；負責行政后勤、計劃生育和社會治安綜合治理等工作；綜合協調人大代表建議、政協委員提案的辦理。負責處理市委審計委員會辦公室日常事務工作，協調督促有關方面落實委員會的決定事項、工作部署和要求；組織開展對涉及全市審計工作重大問題研究，向市委審計委員會提出工作建議。
（二）財務人事股。．負責局機關和二級機構的財務，負責審計事業經費管理；負責系統黨建、紀檢、機構編制、人事管理、機關統計、勞動工資、教育培訓和專業技術職稱考試報名初審、離退休人員管理、工青婦等工作。
（三）法規審理股。負責局機關規范性文件的合法性審核工作；承辦有關行政復議、應訴和其他法律性事務工作；負責審計項目的審理工作，對審計業務部門移交的審計資料在事實、證據、定性、處理處罰、審計程序、審計評價、審計建議等方面進行審理并提出書面審理意見；負責局審計業務會議的會務工作，負責草擬有關審計結論性文書；組織實施審計項目質量檢查，開展審計業務內部監督，對單位內部審計進行指導和監督；核查社會審計機構對依法屬于國家審計監督對象的單位出具的相關審計報告的質量；會同辦理重大審計質量問題的調查處理工作，提出審計質量責任追究意見；組織實施審計業務培訓；指導全局審計業務的法規工作；聯系市審計學會工作。
（四）財政金融審計殷。負責擬訂并組織實施市級預算執行情況的審計工作方案，匯總審計結果；負責組織審計市級預算執行、決算草案及其他財政收支，鄉鎮政府預算執行、決算草案其他財政收支，園區預算執行、決算草案及其他財政收支，市本級稅收征管，中央、省級和益陽市級、市級財政轉移支付資金。組織審計市屬資本占控股或主導地位的金融機構及其直屬單位資產、負債和損益；按照上級審計機關的授權，組織審計國有金融機構和國有資本占控股或主導地位金融機構的資產、負債和損益；負責組織審計我市駐外非經營性機構的財務收支情況，審計市屬國有企業和金融機構的境外資產、負債和損益；根據上級審計機關的授權，組織審計國際組織和外國政府貸款、援助項目的財務收支情況及相關績效情況。
（五）行政事業審計股。負責組織審計市直相關部門及直屬單位、民主黨派、社會團體及其下屬單位的財政財務收支情況。負責組織審計市政府相關部門和其他單位受市政府委托管理的社會保障基金、社會捐贈資金及其他有關基金、資金的財務收支。
（六）農業農村審計股。負責組織審計農業農村、扶貧開發以及其他相關公共資金和建設項目。
（七）政府投資審計股（重大項目審計股、重大項目稽查股）。負責組織審計政府性投資、以政府性投資為主的建設項目以及其他關系到國家利益和公共利益的重大公共工程項目。負責組織開展對重大項目的審計，對市級政府性建設投資計劃安排及賣施情況進行審計監督，對貫徹執行國家投資政策和規定的情況進行審計監督。
（八）自然資源和生態環境審計股。負責組織開展市管領干部自然資源資產離任（任中）審計以及自然資源管理、污染防治和生態保護與修復情況審計。
（九）企業審計股（國有企業監事會管理股）。負責組織審計市屬國有企業或市政府規定的國有資產占控股地位或主導地位的企業及其下屬單位魄資產、負債、損益及財務收支情況和相關績效情況；t組織開展企業領導人員的經濟責任審計；負責市屬國有企業、國有資產占控股或者主導地位的企業監事會管理。
（十）經濟責任審計股。負責組織市管黨政主要領導干部及其他單位主要負責人的經濟責任審計；推進經濟責任審計結果運用；承擔經濟責任審計中與相關部門的溝通協調工作。
（十一）政策跟蹤審計股。負責組織對市直有關單位及下屬單位、園區落實上級有關重大政策措施情況實施跟蹤審計。
（十二）內部審計指導監督股。負責制定全市內部審計發展規劃，指導和監督全市內部審計工作，檢查評價內部審計工作質量。
（十三）審計技術計劃股。負責組織指導信息技術的推廣與應用工作；配合審計業務部門運用計算機進行審計數據分析；承擔重大審計項目的審計數據采集、處理、管理和其他審計技術工作；組織開展信息系統審計和聯網審計；組織、協調、指導“金審工程”項目實施工作；負責局機關計算機設備的日常雛護工作和審計專網、審計外網的管理工作；負責審計項目計劃管理、審計統計工作。
（十四）審計執行股。負責審計結論性法律文書的送達和審計決定的執行；負責審計移送處理事項和審計建議事項以及自行糾正事項的跟蹤落實；負責檢查督促被審計單位對審計查出問題的整改；負責辦理申請法院強制執行事項；負責審計執行情況的統計分析，研究和協調審計執行的相關問題。
第六條市審計局機關行政編制為15名,。設局長1名，副局長2名，總審計師1名，正股級領導職數14名。 機關后勤服務全額事業編制1名（人員只出不進，編制空一減一）。
第七條市審計局所屬事業單位的設置、職責、編制事項規定。沅江市建設投資審計中心為市審計局所屬股級公益類事業單位，核定全額事業編制22名，設主任1名，副主任2名，主要職責是：受市審計局委托，實施對政府投資項目概算或預算執行情況、建設項目的標的編制、設計及工程量變更、工程結算（工程造價）、竣工決算、投資績效等環節的全過程審計監督；對投資規模大、建設周期長和社會關注度高的建設項目有重點安排跟蹤審計；對組織社會中介機構審計項目的質量實施管理和監督。