沅江市衛生健康局設下列內設機構（均為正股級）
（一）辦公室。負責文電、會務、機要、檔案、督查等機關日常運轉工作，承擔綜合性重大問題調研、重要文稿起草、政務公開、安全保密、安全生產、政法、信訪工作、宣傳教育、新聞和信息發布，負責綜合協調人大代表建議、政協委員提案的辦理。
（二）人事股。擬訂全市衛生健康人才發展規劃并組織實施，承擔機關和指導二級機構人事管理、機構編制、系統績效考核、工資福利、隊伍建設、離退休人員服務等工作；負責衛生健康專業技術人員資格管理；負責全系統工、青、婦及關心下一代協會等工作；指導系統、民營醫院黨建工作；負責系統黨風廉政建設工作；負責人事檔案管理。
（三）規劃發展與信息化股。擬訂全市衛生健康事業中長期發展規劃，承擔統籌規劃和協調優化全市衛生健康資源配置工作，指導區域衛生健康規劃的編制和實施，規劃和指導衛生健康公共服務體系建設；承擔衛生健康信息化建設、統計及政府信息公開等工作，參與全市人口基礎信息庫建設；負責立項爭資、招商引資、小康建設及重點建設項目的管理。
（四）財務股（審計股）。承擔機關和預算管理單位預決算、財務、資產管理和內部審計工作。組織實施大型醫用裝備配置管理，指導所屬單位醫療器械采購工作，提出醫療服務和藥品價格政策建議，指導監督社會撫養費管理工作，負責行業財務會計工作的指導和監督。
（五）法規監督股。貫徹落實國家、省衛生法律法規和政策，承擔規范性文件的合法性審核工作，承擔行政復議、行政應訴等工作。承擔公共衛生、醫療衛生等監督工作，查處醫療服務市場違法行為；負責協調有關部門查處違反計劃生育的案件及“兩非”案件工作。組織開展學校衛生、公共場所衛生、飲用水衛生、傳染病防治監督檢查。完善綜合監督體系，指導規范執法行為。會同有關部門開展食品安全標準跟蹤評價，會同有關部門組織開展食品安全事故流行病學調查，組織開展食品安全風險監測和交流。
（六）行政審批股。負責職責范圍內的衛生行政健康許可事項，審核或審批和送達；組織協調行政許可事項的調研論證；負責行政審批事項辦理資料歸檔和信息統計工作；承擔本部門行政審批事項的日常管理；負責建立行政審批事項監督管理制度，并組織實施；負責牽頭實施部門權力清單制度有關工作。負責衛生健康政務窗口管理工作。
（七）體制改革股（市深化醫藥衛生體制改革領導小組辦公室）。承擔市深化醫藥衛生體制改革工作，貫徹落實國家和省、市深化醫藥衛生體制改革政策，組織推進公立醫院綜合改革工作。
（八）疾病預防控制股(職業健康股)。擬訂全市重大疾病防治規劃、免疫規劃、嚴重危害人民健康的公共衛生問題的干預措施并組織實施，完善疾病預防控制體系。組織實施職業衛生、放射衛生相關政策、標準。開展重點職業病監測、專項調查、職業健康風險評估和職業人群健康管理工作。協調開展職業病防治工作。
（九）醫政醫管股(科技教育股)。負責全市醫政管理工作。負責擬訂全市醫療機構設置規劃；負責醫療機構、醫療衛生技術人員、醫療新技術（項目）準入、審批和監督管理工作；負責全市醫療護理質量的監督管理與行風建設等；負責醫療事故爭議的受理和處置；依法監督管理臨床用血質量和無償獻血工作；擬訂公立醫院運行監管、績效評價和考核制度。協助政府對重大傷亡事件實施緊急救護；擬訂全市衛生健康科技發展規劃及相關政策并組織實施。承擔醫教協同醫學人才培養工作；承擔病原微生物實驗室生物安全監管工作。組織開展住院醫師規范化培訓、�？漆t師培訓、全科醫師培養及繼續醫學教育工作。負責全市征兵體檢；負責其他相關醫療政務的綜合管理。
（十）藥品器械管理股。貫徹執行國家、省藥物政策和國家基本藥物制度，開展藥品使用監測、臨床綜合評價、短缺藥品監測預警。推進醫療機構藥事服務管理，協助基本藥物資金分配預算及監管；負責醫用設備計劃申報審批、備案，醫用耗材使用監管等工作。
（十一）基層衛生健康股。牽頭實施國家和省基層衛健康政策、標準和規范，指導全市基層衛生健康服務體系建設和鄉村醫生相關管理工作，組織實施國家基本公共衛生服務項目。
（十二）老齡健康股。擬訂并協調落實應對老齡化的政策措施。組織擬訂醫養結合的政策、標準和規范，建立和完善老年健康服務體系。承擔市老齡工作委員會辦公室的日常工作。
（十三）婦幼健康股。組織實施婦幼衛生健康政策、規劃、技術標準和規范；推進婦幼衛生健康服務體系建設，指導管理全市婦幼衛生、出生缺陷防治、嬰幼兒早期發展、人類輔助生殖技術和生育技術服務工作。
（十四）人口監測與家庭發展股。承擔人口監測預警工作并提出人口與家庭發展相關政策建議，落實生育政策，建立和完善計劃生育特殊家庭扶助制度。
（十五）中醫藥管理股。擬訂全市中醫藥事業發展規劃和年度計劃并組織實施；擬訂全市中醫、中西醫結合、民族醫療和保健機構及其技術應用的管理規范和地方標準并組織實施，對其他醫療機構中醫業務進行指導；貫徹執行中醫醫療、預防、保健、康復等人員的執業資格標準和服務規范；承擔中醫醫療機構、醫療服務的監管工作以及中醫診所的備案管理工作。擬訂全市中醫藥人才發展規劃和中醫藥專業技術人員資格標準并組織實施；組織實施中醫藥重點科研項目，促進中醫藥科技成果轉化、應用和推廣。
（十六）血吸蟲病預防控制股。擬訂全市血吸蟲病防治工作中長期規劃和年度計劃并組織實施；指導開展全市血吸蟲病防治知識宣傳普及、業務技術管理和督導工作；承擔市血吸蟲病防治工作領導小組辦公室的日常工作；負責協調有關部門開展血吸蟲病的綜合防治工作。
（十七）愛國衛生工作股（市愛國衛生運動委員會辦公室）。貫徹執行國家、省、市愛國衛生工作的政策和法律法規，擬訂全市愛國衛生工作的中長期規劃并組織實施；統籌協調市愛國衛生運動委員會各成員單位工作責任的落實；組織開展衛生創建和管理工作；組織實施農村改廁工作；負責開展群眾性衛生監督和城鄉環境衛生評價工作；組織開展病媒生物防制工作，負責全市病媒生物防制工作的技術指導。承擔市愛國衛生運動委員會日常工作。